автореферат диссертации по информатике, вычислительной технике и управлению, 05.13.01, диссертация на тему:Кинетика клеточных процессов в норме и патологии
Оглавление автор диссертации — доктора биологических наук Сыроешкин, Антон Владимирович
ВВЕДЕНИЕ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
I. Основания химической кинетики.
II. Кинетические механизмы ферментативных реакций 10 II. 1. Механизм Михаэлиса-Ментен 10 II. 2. Механизм Бриггса-Холдейна
11.3. Механизм с участием изомеризующихся форм фермента
11.4. Кооперативные механизмы.
11.5. Полиферментные системы. Условия ферментативного катализа in vivo (в составе клетки)
11.6. Fj-Fo АТРаза- олигомерный мембранный фермент, катализирующий сопряженные процессы переноса фосфорильной группы и трансмембранного транспорта протонов
III. Особенности описания взаимодействия клеток с токсическими лигандами 28 III. 1. Кинетические механизмы действия ингибиторов на уровне ферментов
Ограничения при исследовании действия на клетку в целом
111.2. Применение феноменологии химической кинетики к описанию роста клеточных популяций. Кинетическая проблема дормантных и споровых состояний клетки
111.3. Токсичность ряда неорганических соединений и методы ее прогнозирования
111.4. Прогнозирование действия на клетку органических соединений по методу ККСА-ККСС (количественных корреляций структура-активность, структура-свойство) с помощью топологических индексов
IV. Условия клеточного формообразования 51 IV. 1. Клетка как межфазный химический реактор 51 IV.2. Отличия живого вещества от неживого 53 IV.3. Модели формообразования клеток
МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
I. Модель клетки как полиферментного многофазного химического реактора
1.1. Единая теория ферментативного катализа на основе реализации принципа диссиметрии Кюри-Пастера в локально анизотропных средах
1.2. Реализация принципа Кюри на примере кинетического механизма сопряжения векторного и скалярного процесса при катализе
FrF0 АТРазой синтеза/гидролиза АТР
1.3. Прямая демонстрация векторных конформационных превращений митохондриальнои грго АТРазы
1.4. Квазихимическое описание кинетики гибели клеток на основе общей теории ферментативного катализа
1.5. Интегральный элементный метаболизм как проявление присутствия в клетке межфазных границ: типирование физиологических состояний клетки по элементному профилю
II. Применение метода ККСА-ККСС (количественных корреляций структура-активность, структура-свойство) при кинетическом исследовании действия лекарственных веществ
III. Формообразование клеток в норме и патологии
111.1. Изучение формообразования клетки при комбинированном токсическом действии ионов цинка и меди (II)
111.2. Детекция и дифференциальная диагностика
Mycobacteria tuberculosis
111.3. Мониторинг и дифференциальная диагностика острого лимфобластного лейкоза у детей 8-12 лет
111.4. Теория формообразования клетки как процесса формирования трехмерной сложной поверхности
111.5. Применение метода исследования распределения клеток по размерам и форме для целей мониторинга состояния клеток (биоценозов) и медицинской диагностики
111.6. Колонеобразование у прокариот как проблема инфекционной патологии
Заключение диссертация на тему "Кинетика клеточных процессов в норме и патологии"
166 выводы
1. Теория ферментативного катализа на основе механизма реализации принципа Кюри в локально анизотропных средах позволяет дать единое описание для механизма катализа АТРаз Fj-Fo типа, ЕГЕ2 типа, процессивных ДНК-полимераз и других ферментов.
2. Митохондриальная АТР-синтетаза претерпевает векторные конформационные переходы по пути взаимного сближения/удаления Fi и F0 частей, что отражает способ соблюдения приниципа Кюри при катализе сопряженных процессов векторного переноса протона и скалярного образования АТР.
3. Комбинирование топологических индексов и кинетической теории клеточных превращений позволяет количественно описывать взаимодействие клеток с химическими соединениями и разрабатывать лекарственные вещества с заданными свойствами.
4. Система соответствий - топология клеточной поверхности - вид клетки - состав окружающей среды, и представления о клетке как о полиферментном реакторе являются основой новой теории клеточного формообразования.
5. На основании теории клеточного формообразования и изучения размерных спектров клеточных популяций создан и апробирован новый метод медицинской диагностики по размерам и форме референтных клеток.
6. Элементный профиль является способом типирования видовой принадлежности клетки и ее физиологического статуса.
7. Колонии и ассоциаты у прокариот могут составлять значительную долю (10-90%) бактериальной популяции, что представляет собою особую проблему при развитии инфекционных заболеваний.
167
8. Кинетика гибели клеток, образование новых форм (устойчивых к лекарствам, дормантных форм, спор) редукционно описываются путем обобщения теории ферментативного катализа на основе принципа Кюри на клетку как полиферментную систему.
9. Имманентными физико-химическими свойствами клетки (минимальной единицы живого вещества), несводимыми к ее функционированию как полиферментной системы является сочетание способности к гомеоморфным изменениям формы и особого способа формирования элементного состава.
168
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
В настоящей работе мы продемонстрировали, что кинетика ферментативных реакций может быть рассмотрена с единой позиции теории ферментативного катализа на основе принципа Кюри-Пастера. Эта теория рассматривает конформационные превращения Кошланда, сопровождающиеся изменением сродства к субстратам/продуктам, как векторные. Условие векторности есть следствие выполнения условия сопряжения процессов, являющихся тензорами разного ранга. Показано, что представления о клетке, как полиферментной системе позволяет применить и, в ряде случаев, выявить смысл параметров, кинетику ферментативных процессов к клеточным превращениям. Для тех случаях, когда константы равновесий процессов связывания лигандов с клеткой трудно или невозможно определить, возможно применение топологических индексов, отражающих и кинетику и термодинамику воздействия химических веществ на клетку. Для описания клетки как многофазного химического реактора недостаточно кинетики ферментативных реакций, что демонстрирует несоблюдение уравнения Штрауса-Гольдштейна для взаимодействия клетки с фоновыми переходными металлами. Оказалось, что исследование распределений клеток популяции по размерам и форме (размерным спектрам) позволяет изучать взаимодействие клетки как целого с химическими веществами и физическими факторами, инфекционными возбудителями, а также при генных нарушениях. Формообразование клетки при взаимодействия с лигандами можно редукционно описать по теории ферментативного катализа на основе принципа Кюри. В общем случае теория формообразования была построена нами с применением топологических представлений, приводящих к формулировки положения о полимодальной норме реакции размерных спектров клетки, зависящих как от генного контроля, так и от
162 состава внешней среды. Рассмотрим схему, суммирующую сходства и различия между последним в биосистемах иерархическим уровнем неживой природы (если и биогенного происхождения, то при принципиальной возможности искусственного синтеза) и первым уровнем, несущим свойства собственно живого вещества - клеткой (таблица 2)*. Такой анализ взаимодействия клетки с низкомолекулярными лигандами позволит в дальнейшем развивать идеологию «целлюлярной патологии» Р. Вирхова с использованием новейших методологических подходов системного анализа, в частности, представлений о болезни, как нарушении информационного процесса [109а]. Это может, в свою очередь, послужить основанием для дальнейшего развития феноменологических методов диагностики и мониторинга заболеваний (например, на основе размерных спектров клеток), а также методов лечения, направленных на изменение организма как целого (например, учитывающих кинетику процессов и «сопряженность» метаболизма металлов Мы сознаем, что и эта грань размыта в органеллах эукариот, но органеллы (митохондрии, хлоропласта и т.д.) не существуют самостоятельно, искусственно выделенные - гибнут с суточной кинетикой, и не могут быть собраны in vitro с полноценными функциями (хотя бы по поддержанию трансмембранного потенциала). Все сказанное методически позволяет не рассматривать в нашей работе этот уровень организации клетки.
163
Библиография Сыроешкин, Антон Владимирович, диссертация по теме Системный анализ, управление и обработка информации (по отраслям)
1. Авцын А.П. Микроэлементозы человека. М.: Медицина. - 1991. - 494 с.
2. Адаме Р., Методы культуры клеток дня биохимиков. 1983, М., Мир, пер. с англ., 263 с.
3. Айзеншитц Р. Статистическая теория необратимых процессов. М.: ИЛ. - 1963. -324 с.
4. Алексеев C.B., Кадыскина E.H., Свистунов Н.Т., Лексеева Л И., Бухарин Е.А., Калинина Л.И. Некоторые биохимические аспекты действия инфразвуковых колебаний на организм// Гиг. труда и проф. забол. 1980. - № 4. - С. - 21-24.
5. Альберт А. Избирательная токсичность. В 2 т. М.: Медицина. -1989. Т. 2. - 429с.
6. Альберт А. Избирательная токсичность. В 2 т. М.: Медицина. -1989. Т. 1. - 400с.
7. Антропов Л.И. Теоретическая электрохимия. М.: Высшая школа, 1965. С.116-119.
8. Арнольд М. Теория катастроф. М.: Мир. - 1992. - 57 с.
9. Барашков Г.К. Краткая медицинская бионеорганика. М.: Гэотар Медицина. -1999. - 66 с.
10. Бариш М., Яшари Дж., Лалл Р., Шривастава В., Тринайстич Н. Матрица расстояний для молекул, содержащих гетероатомы // Химические приложения топологии и теории графов. -М.: Мир. 1987. -С. 259-265.
11. Басоло Ф., Пирсон Р. Механизмы неорганических реакций. М.: Мир. - 1971. -592 с.169
12. Болдырев A.A. Биологические мембраны и транспорт ионов. М.: Наука. - 1985. -350 с.
13. Больцман JL Статьи и речи. М.: Наука, 1970. - 406 с.
14. Брезгунов В Н., Бунин В.Д., Попов В.Ж., Иванов Н.В., Самойленко В.А. Анализ изменений электрофизических и морфометрических параметров в периоды роста и споруляции Bacillus thuringiensis!/Микробиология. 1984. - Т. 53. - С. 381-386.
15. Бухарин О.В. Персистенция патогенных бактерий. М.: Медицина, 1999. - 366 с.
16. Варфоломеев С.Д., Гуревич К.Г. Биокинетика, М.: ФАИР-ПРЕСС. 1999. - 720 с.
17. Варфоломеев С.Д., Калюжный C.B. Биохимия. 1991. С. 1731-1747.
18. Вернадский В.И. О влиянии живых организмов на изотопические смеси химических элементов. ДАН СССР. -1931. С. 141-147.
19. Вернадский В.И. О химическом элементарном составе рясок (Lemna) как видовом признаке. ДАН СССР. - 1931. С. 148-152.
20. Вернадский В.И. Философские мысли натуралиста. М.: Наука. - 1992. - 412 с.
21. Вернадский В.И. Химическое строение биосферы Земли и ее окружения. М.: Наука. - 1987. - 340 с.
22. Вигнер Е. Этюды о симметрии. -М.: Мир. -1971. 320 с.
23. Виноградов А.Д. Каталитические свойства митохондриальной АТФ синтетазы// Биохимия,- 1984. Т. 49. - № 8. - С. 1220-1238.
24. Виноградов А. Д. Митохондриальнаяй АТФ синтетазы: 15 лет спустя// Биохимия,- 1999. Т. 64. - № 11. - С. 1219-1229.
25. Галкин М.А., Сыроешкин A.B. Кинетический механизм реакции синтеза АТР, катализируемои митохондриальнои rj-ro АТРазой// Биохимия. 1999. - Т. 64. - Вып. 10.-С. 1393-1403.170
26. Гика М. Эстетика пропорций в природе и искусстве. М.: Изд-во ВАА, 1936. -311 с.
27. Гинзбург П.С. Фтивазид-устойчивые штаммы туберкулезных микобактерий и их биологические особенности// Проблемы туберкулеза. №1. - 1957. - с. 84-87.
28. Гутина В.Н., Кузьмин В.В. Теория молекулярной диссиметрии JI. Пастера. М.: Наука. - 1990.-216 с.
29. Денбиг К. Термодинамика необратимых прпоцессов. М: ИЛ. - 1978. - 347 с.
30. Дженкс П. Катализ в химии и энзимологии. М.: Мир, 1978. - 543 с.
31. Диксон М., Уэбб Э.С. Ферменты. 1961. - М.: Изд-во И.Л. - 728 с.
32. Епифанова О.И., Терских В.В., Полуновский В.А. Покоящиеся клетки. 1983. М.: Наука. - 215 с.
33. Епифанова О.И., Терских В.В., Полуновский В.А. Регуляторные механизмы пролиферации клеток. 1988. - М.: ВИНИТИ. - Итоги науки и техники. - т. 10.
34. Ершов Ю.А. Квазихимические модели динамики клеточных популяций под действием ингибиторов и активаторов роста// Прикл. биохим. микробиол. 1999. - Т.35. -№3. С. 275-281.
35. Ершов Ю.А. Квазихимические модели роста биологических популяций под действием ингибиторов и промоторов//Ж. физ. химии. 1998. - Т. 72. - №3 - С. 553-559.
36. Ершов Ю.А. Термодинамика квазиравновесий в биологических системах. М. ВИНИТИ. - 1983. - 138 с.171
37. Ершов Ю.А., Плетенева T.B. "Механизмы токсического действия неорганических соединений". М.: Медицина. 1989. - 272 с.
38. Журавлев В.А. Термодинамика необратимых процессов. М.: Наука, 1979. - 136 с.
39. Иванов П.Л. Происхождение многоклеточных животных. М.: Наука. - 1962. -407 с.
40. Измайлова В.Н., Ямпольская Г.П., Сумм Б.Д. Поверхностные явления в белковых системах. М.: Химия. - 1988. - 240 с.
41. Иммобилизованные ферменты и клетки. Под ред. Дж. Вудворта. М.: Мир. -1988.215 с.
42. Ионы металлов в биологических системах. Амбивалентные свойства нуклеотидов/ Ред. X. Зигель. М.: Мир. - 1982. - 168 с.
43. Каменир Ю.Г. Исследование структуры живого вещества водоемов на основе размерных спектров// Биол. науки. 1987. - Т. 8. - С. 70-77.
44. Кантор Ч., Шиммел П. Биофизическая химия: В 3 т. М.: Мир. -1985. - Т. 3. - 534 с.
45. Кантор Ч., Шиммел П. Биофизическая химия: В 3 т. М.: Мир. -1985. - Т. 2. - 536 с.
46. Келети Т. Основы ферментативной кинетики. М.: Мир. - 1990. - 350 с.
47. Кивман Г. Я., Рудзит Э.Я., Яковлев В. П., Фармакокинетика химиотерапевтических препаратов. М.: Медицина. - 1982. - 215 с.
48. Клинов C.B., Курганов Б.И., Чеботарева H.A., Жилина Т.А., Литвак З.И. Взаимодействие мышечной гликогенфософрилазы b с рибофлавином, его тетраацетилпроизводным и их аналогами// Биоорган, хим. 1988. - Т. 14. № 8. - С. 1027-1033.172
49. Котрикадзе H.Г., Ломсадзе M.А., Царидзе М.А., Джишкариани О.С., Левашов A.B. Регуляция каталитических свойств ферментов в обращенных мицеллах// Биофизика. 1999. - Т. 44. - № 2. С. 231-235.
50. Красновский A.A., Неверов К.В. Образование триплетных молекул хлорофилла и его предшественников в обработанных 5-аминолевулиновой кислотой листьях растений//ДАН. 1988. - Т. 302. - С. 252-255.
51. Крупянко В.И. Векторный метод представления ферментативных реакций. М.: Наука. - 1990. - 144 с.
52. Куратовский К. Топология, т. 1. -М.: Мир. 1966. - 594 с.
53. Курганов Б.И. Аллостерические ферменты. М.: Наука. - 1978. - 250 с.
54. Курганов Б.И., Любарев А.Е. Принципы организации и функционирования метаболон-микрокомпартментов//Биохимия. 1989. - Т. 54. - № 5. - С. 716-718.
55. Либов Р. Введение в теорию кинетических уравнений. М.: Мир, 1974. - 371 с.
56. Магнусон В., Харрис Д., Бейсак С. Топологические индексы, основанные на симметрии окрестностей: химические и биохимические применения// Химические приложения топологии и теории графов. -М.: Мир. 1987. -С. 206-221.
57. Малькова И.А., Попова C.B., Сельков Е.Е. Множественные автоколебательные и стационарные состояния в открытой реакции, катализируемой фосфофруктокиназой Е. coli. Количественная модель//Биофизика. 1980. Т. 25. № 3. с. 503-507.
58. Мамулат A.C. Клиническое значение лекарственной устойчивости при туберкулезе// Проблемы туберкулеза. №8. - 1963. - с. 28.
59. Межей П. Реакционная топология: теория многообразия потенциальных поверхностей и квантовохимический дизайн синтеза// Химические приложения топологии и теории графов. -М.: Мир. 1987. -С. 91-116.173
60. Межфазный катализ. Химия, катализаторы и применение// под ред. Ч. М. Старкса. М.: Химия. - 1991. - 160 с.
61. Мелвин-Хьюз Э.А. Физическая химия. Книга 1,- М.: Изд-во И.Л., 1962. - 519 с.
62. Мелконян М.М. Процессы перекисного окисления липидов и динамика сдвигов в уровне холестерина в плазме и мембранах эритроцитов в условиях воздействия низкочастотных колебаний// Вопр. Мед. Химии. 1989. - № 4. - С. 12-16.
63. Микрюков К.А. Изучение ультраструктуры и сравнение генов рРНК как методы построения системы протестов// Зоологический журнал. 1999. - Т. 79. - С. 1-15.
64. Москалев Ю.И. Минеральный обмен. М.: Медицина. 1985. - 288 с.
65. Отмер X. Глобальная динамика некоторых классов реакционных систем// Химические приложения топологии и теории графов. М.: Мир. - 1987. -С. 322-348.
66. Петухов В.Г. О физической регистрации и природе ультрафиолетового излучения микроорганизмов//Биохемилюминисценция. — М.: Наук. 1983. - с. 222.
67. Печуркин Н.С., Тарсков И.А. Анализ кинетики роста и эволюции микробных популяций. Новосибирск: Наука. - 1975. - 287 с.
68. Плетенева Т.В. Прогнозирование экологической опасности неорганических соединений по их физико-химическим свойствам: Автореф. дис. . д-ра химических наук.-М., 1993.- 84 с.
69. Плетенева Т.В. Физико-химические факторы токсичности неорганических соединений// Тезисы XVI Менделеевского съезда по общей и прикладной химии. -1998. С.-П.-с. 210.
70. Плетенева Т.В., Ершов Ю.А., Тюкавкина Н.А., Руленко И.А., Сенюк Т Ф., Фоменко Н.А., Долгополова В.А. Влияние хелатирующих агентов полифенолов - на биологическую активность ионов металлов//
71. Плетенева Т.В., Слонская Т.К., Каптерева Ю.В., Ершов Ю.А. Исследование действия ионов серебра и меди на культуру дрожжей S. cereviseall «Серебро в медицине, биологии и технике». СО РАМН Новосибирск. 1995. - №4. - С. 131-137.
72. Плетенева Т.В., Тарнавская Н.А., Есменская Н.Б., Ершов Ю.А. Комбинированное действие растворов серебра и меди на инфузорий Paramecium caudatumll «Серебро в медицине, биологии и технике». СО РАМН Новосибирск. 1995. - №4. - С. 124-130.
73. Поглазов Б.Ф., Бурнашев С.А. Немышечные двигательные системы. -М.:ВИНИТИ. 1989. - 176 с.
74. Прасолов В.В. Наглядная топология. -М.: МЦНМО. -1995. 112 с.
75. Пригожин И., Дефей Р. Химическая термодинамика// Новосибирск: Наука. -19966.-405 с.
76. Рист Н. К вопросу о тиамиде а-этилизоникотиновой кислоты, новом противотуберкулезном препарате, действующем на изониазид-устойчивые бациллы// Проблемы туберкулеза. №4. - 1959. - с. 24.
77. Романовский Ю.М. Проблемы математической биофизики. М.: Изд-во МГУ. -1981.- 35 с.175
78. Романовский Ю.М., Степанова Н.В., Чернавский Д.С. Математическое моделирование в биофизике. М.: Наука. - 1975. - 343 с.
79. Руврэ Д. Следует ли заниматься разработкой топологических индексов// Химические приложения топологии и теории графов. М.: Мир. - 1987. -С. 183-205.
80. Савченко В.Г., Паровичникова Е.Н. Острые лейкозы// Клиническая онкогематология. М.: «Медицина». - 2001. - с. 156-207.
81. Селлерс П. Классификация механизмлв химических реакций с геометрической очки зрения // Химические приложения топологии и теории графов. М.: Мир. - 1987. -С. 472-480.
82. Скулачев В.П. Энергетика биологических мембран. М.: Наука, 1989. С. 20-75.
83. Слонская Т.К., Плетенева Т.В., Ершов Ю.А. Оценка биологической активности токсических агентов с помощью одноклеточных моделей// Бюл. эксп. биол. и мед. -1997. Т. 123. - № 5. - С. 519-526.
84. Слонская Т.К., Плетенева Т.В. Комбинированное действие ионов серебра и меди на культуру дрожжей// «Серебро в медицине, биологии и технике». СО РАМН Новосибирск. 1995. - №4. - С. 138-142.
85. Спектроскопические методы исследования в физиологии и биохимии. Л: Наука. - 1987.-205 с.
86. Степанян М.С., Сергеев В.В. Лекарственная устойчивость микобактерий туберкулеза при лечении циклосерином больных туберкулезом легких// Проблемы туберкулеза. №8. - 1962. - с. 84-87.176
87. Сусликов В.JI. Геохимическая экология болезней. В 2 т. М.: Гелиос АРВ. - 1999.
88. Сыроешкин A.B., Байкова В Н., Захарова Н.В., Плетенева T.B. VII Российский национальный конгресс "Человек и лекарство", Тезисы докладов. Москва. - 2001. - С. 320.
89. Сыроешкин A.B., Галкин М.А., Седлов A.B., Виноградов А.Д. Кинетический механизм реакции гидролиза АТР митохондриальной FrF0 АТРазой: участие ионов Mg2+ в гидролизе комплекса Mg*ATP// Биохимия. 1999. - Т. 64. - Вып. 10. -С. 13371347.
90. Сыроешкин A.B., Лебедев И.М., Слонская Т.К. Проблема неаддитивных эффектов при комбинированном токсическом воздействии химических соединений// Конференция молодых ученых национальных гидрометслкжб стран СНГ. Тезисы докладов. М. - 1999. - с. 70-71.
91. Сыроешкин A.B., Плетенев С.С., Плетенева Т.В., Лебедев И.М., Синюк Т. Ф. Антагонизм в токсическом действии ионов меди и цинка в водных растворах// Гальванотехника и обработка поверхности. 1997. - № 3. - С. 48-51.
92. Сыроешкин A.B., Плетенева Т.В. Прогнозирование биологической активности химических соединений. Проблемы и перспективы// Научно-педаг. конференция "Медицинское образование в наступающем XXI веке", РУДН. 2000. - М. - С. 28-30.
93. Сыроешкин A.B., Синюк Т.Ф., Лебедев И.М., Плетенева Т В., Кирьянов C.B. Изучение антагонизма в токсическом действии ионов меди и цинка в водных растворах// Метеорология и гидрология. 2000 - № 10. - С. 55-61.
94. Сыроешкин A.B., Синюк ТФ., Лебедев И.М., Плетенева Т.В., Кирьянов C.B. Изучение антагонизма в токсическом действии ионов меди и цинка в водных растворах//Метеорология и гидрология. -2000. № 10. - С. 55-61.
95. Сыроешкин A.B., Шокина О.Н., Исаков В.А., Матвеева И.С., Коршенко АН. Химическое загрязнение восточной части Финского залива и проблема токсичности морских аэрозолей (16 с.)// Труды ГОИН. М.: Росгидромет. - 2001.
96. Туберкулез/под ред А.Г. Хоменко. М.: Медицина, 1992. - 312 с.178
97. Уайт А., Хендлер Ф., Смит Э., Хилл Р., Леман И. Основы биохимии. В 3 т. М.: Мир. - 1981. - 1878 с.
98. Урманцев Ю.А. Симметрия природы и природа симметрии. М.: Мысль. 19743. -229 с.
99. Уэбб Л. Ингибиторы ферментов и метаболизма. -М.: Мир. 1966. - 862 с.
100. Феттер К. Электрохимическая кинетика. М.: Наука, 1968. - 856 с.
101. Фултон А. Цитоскелет. Архитектура и хореография клетки. М. Мир. - 1987 -120 с.
102. Фултон А. Цитоскелет. Архитектура и хореография клетки. М.: Мир. - 1987. -120 с.
103. Харгиттаи И., Харгиттаи М. Симметрия глазами химика. М.: Мир. - 1989. - 495с.
104. Хасс Е., Плят П. Многомерная Х-модель. Теоретико-графовый и алгебраический подход к описанию механизмов сложных химических реакций// Химические приложения топологии и теории графов. М.: Мир. - 1987. -С. 457-471.
105. Хмельницкий O.K. Цитологическая и гистологическая диагностика заболеваний шейки и тела матки. С.-П.: Сотис. — 2000. - 336 с.
106. Хочака П., Сомеро Дж. Биохимическая адаптация. М.: Мир, 1988. - 568 с.
107. Хьюз М. Неорганическая химия биологических процессов. М: Мир. - 1983. -414 с.179
108. Шинкарев В.П., Венедиктов П.С. Вероятностное описание процессов транспорта электронов в комплексах молекул переносчиков// Биофизика. 1977. - т. 22. № 3. С. 1522.
109. Яглов В.В., Далин Ю.М., Евстафьева Н.Я. Влияние низкочастотных акустических колебаний на морфо-функциональное состояние эндокринной системы// Гиг. труда и проф. забол. 1987. - № 5. - С. 47-50.
110. Abrahams J.P., Leslie AG., Lutter R., Walker J.E. Structure at 2.8 A resolution of Fr ATPase from bovine heart mitochondria// Nature. 1994. - V. 370(6491). - P. 621-628.
111. Ainscow E.K., Brand M.D. Control analysis of systems with reaction blocks that 'cross-talk'// Biochim. Biophys. Act a. 1998. -V. 1366. - N3. - P. 284-290.
112. Ainscow E.K., Brand M.D. Control analysis of systems with reaction blocks that «cross-talk»// Biochim. Biophys. Acta. 1998. - V. 1366. No. 3. - P. 284-290.
113. Anfmsen C.B., Scheraga H.A. Experimental and theiretical aspects of protein folding// Adv. Prot. Chem. 1975. - V. 29. P. 205-214.
114. Anke M., Groppel В., Kronemann H., Grun M. Nickel an essential element// IARC Sci. Publ. - 1984. - V. 53. - V. 339-365.
115. Appanna V.D., Hamel R. Aluminum detoxication mechanism in Pseudomonas fluorescens is dependent on iron// FEMS Microbiol. Lett. 1996. - V. 143. - No. (2-3). - P. 223-228.
116. Applewhite PB Drugs affecting sensitivity to stimuli in the plant Mimosa and the protozoan Spirostomum// Physiol. Behav. 1972 - V. 9. No. 5. P. 869-871.
117. Aranyi P., Toth J. A full stochastic description of the Michaelis-Menten reaction for small systems//Acta Biochim. Biophys. Acad. Sci. Hung. 1977. - V. 12. - P. 376-388.
118. Arrhenius S. Z.// Physikal. Chem. 1889. B. 4. P. 226 -232.180
119. Artacho-Perula E., Roldan-Villalobos R. Unbiased stereological estimation of the number and volume of nuclei and nuclear size variability in invasive ductal breast carcinomas//J. Microsc. 1997. -V. 186. - P. 133-142.
120. Bala S., Kombrabail M.H., Prabhananda B.S. Effect of phloretin on ionophore mediated electroneutral transmembranetranslocations of H*, K+ and Na+ in phospholipid vesicles//Biochim. Biophys. Acta. 2001. - V. 1510. - No. - (1-2). - P. 258-69.
121. Balasubramanian K. Integration of graph theory and quantum chemistry for structure-activity relationships// SAR QSAR Environ. Res. 1994. - V. 2. P. 59-77.
122. Bartels PC., Schoorl M. Mean corpuscular volume-dependent deviations in red blood cell distribution width between Sysmex NE-8000 and SF-3000// Eur. J. Clin. Chem. Clin. Biochem. 1997. - V. 35. - P. 549-550.
123. Beaman T.C., Pankratz H.S., Gerhardt P. Heat shock affects permeability and resistance of Bacillus stearothermophilus spores// Appl. Environ. Microbiol. 1988 - V. 54. -P. 2515-2520.
124. Bechinger B. Understanding peptide interactions with the lipid bilayer: a guide to membrane-protein engineering// Curr. Opin. Chem. Biol. 2000. - Vol. 4. — No. 6. - P. 639644.
125. Berridge M.J. The versatility and complexity of calcium signaling// Novartis Found. Symp. 2001 - V. 239. - P. 52-64.
126. Bertsova YV, Bogachev AV, Skulachev VP. Two NADH:ubiquinone oxidoreductases of Azotobacter vinelandii and their role inthe respiratory protection// Biochim. Biophys. Acta. 1998. - V. 1363. - N2. -P. 125-133.
127. Bianchet M.A., Hullihen J., Pedersen P. L., Amzel L. M. The 2.8-Á structure of rat liver FrATPase: Configuration of a critical intermediate in ATP synthesis/hydrolysis// Proc. Natl. Acad. Sci. -1998. Vol. 95. - No. 19.-P. 11065-11070.181
128. Birndorf N.I., Pentecocost J.O., Coakley JR., Spackman K.A. An expert system to diagnose anemia and report results directly on heamatology forms// Comput. Biomed. Res. -1996.-V. 29.-P. 16-26.
129. Blagoeva I.B., Toteva M.M., Ouarti N., Ruasse M.F. Changes in the relative contribution of specific and general base catalysis in cationic micelles// J. Org. Chem. 2001. -V. 66.-No. 6. - P. 2123-2130.
130. Block S.M. Real engines of creation//Nature. 1997. - V. 386(6622). - P. 217-219.
131. Bovill R.A., Mackey B.M. Resuscitation of'non-culturable' cells from aged cultures of Campylobacter jejuni// Microbiology. 1997 -V. 143. - P. 1575-1581.
132. Boyer P.D. Catalytic site forms and controls in ATP synthase catalysis// Biochim. Biophys. Acta. 2000. - V. 1458. - No. 2-3. - P. 252-262.
133. Boyer P.D. The binding change mechanism for ATP synthase—some probabilities andpossibilities//Biochim. Biophys. Acta. 1993. - V. 1140. N3. - P. 215-250.
134. Brenneman K.A., Cattley R.C., Ali S.F., Dorman D.C. Manganese-induced developmental neurotoxicity in the CD rat: is oxidative damage a mechanism of action?// Neurotoxicol. 1999. - V. 20. - No. (2-3). - P. 477-487.
135. Briggs G.E., Haldane B.S. A note on the kinetic of enzyme action// Biochem. J. 1925. - V. 19. - P. 338-344.182
136. Buligyn V.V., Syroeshkin A.V., Vinogradov A.D. Nucleotide/FT-dependent change in Mg2+ affinity at the ATPase inhibitory site of the mitochondrial FrF0 ATPase// FEBS Lett. -1993. V. 328. - P. 193-196.
137. Bulygin V.V., Vinogradov A.D. Interaction of Mg2+ with F0F! mitochondrial ATPase as related to its slow active/inactive transition// Biochem. J. 1991. - V. 276. - P. 149-156.
138. Buolamwini J.K., Raghavan K., Fesen M.R., Pommier Y., Kohn K.W., Weinstein J.N. Application of the electroitopological state index to QSAR analysis of flavone derivativesb as HIV-1 integrase inhibitor//Pharm. Res. 1996. - V. 13. - P. 1892-1895.
139. Butt T.R., Sternberg E.J., Gorman J.A., Clark P., Hamer D., Rosenberg M., Crooke S.T. Cooper metallothionein of yeast, structure of the gene, and regulation of expression// Proc. Natl. Acad. Sei. 1984. -V. 81.-P. 3332-3336.
140. Capaldi R.A., Lucken U., Gogol E.P. Structure of the ATP synthase complex (EcFiFo) of Escherichia coli from cryoelectron microscopy// Biochemistry. 1990. - V. 29. - No. 22. -P. 5339-5343.
141. Capaldi R.A., Schulenberg B., Murray J., Aggeier R. Cross-linking and electron microscopy studies of the structure and functioning of the Escherichia coli ATP synthase// J. Exper. Biol. 2000. - V. 203. P. 29-33.
142. Carpenter D.O., Matthews M.R., Parsons P.J., Hori N. Long-term potentiation in the piriform cortex is blocked by lead// Cell. Mol. Neurobiol. 1994. - V. 14. - No. 6. - P. 723733.183
143. Catterall W.A., Pedersen P.L. Adenosine triphosphatase from rat liver mitochondria I. Purification, homogeneity, and physical properties// J. Biol. Chem. 1971. - V. 246. - No. 16. p. 4987-4994.
144. Cazoulat A., Gerasimo P., Burgada R., Bailly T. Topological structure activity analyses of diphosphonates in the elimination of radionuclides from body// Ann. Pharm. Fr. 1997. V. 55. N3. P. 125-134.
145. Chan S., Gerson B., Subramaniam S. The role of copper, molybdenum, selenium, and zinc in nutrition and health// Clin. Lab. Med. 1998. - V. - 18. - No. 4. - P. 673-685
146. Cheng L, Liu S, Dixon K. Analysis of repair and mutagenesis of chromium-induced DNA damage in yeast, mammalian cells, and transgenic mice// Environ. Health Perspect. -1998. V. 106. - P. 1027-1032.
147. Cherepanov, D. A., Mulkidjanian, A. Y. and Junge, W.// Transient accumulation of elastic energy in proton translocating ATP synthase. FEBS Lett. - 1999. - V. 449. - P. 1-6.
148. Cleland W.W. The kinetics of enzyme-catalyzed reactions with two or more substrates or products. II. Inhibition: nomenclature and theory. Biochim. Byophys. Acta. - 1963. - V. 67. - P. 173-187.
149. Connell N.D. Mycobacterium: isolation, maintenance, transformation, and mutant selection// Methods Cell Biol. 1994. - V. 45. - P. 107-125.
150. Cross R.L., Nalin G.M. Adenine nucleotide binding sites on beef heart FrATPase. Evidence for three exchangeable sites that are distinct from three noncatalytic sites// J. Biol. Chem. 1982. - V. 257. - No. 6. - P. 2874-2881.184
151. Cunningham A.F., Spreadbury C.L. Mycobacterial stationary phase induced by low oxygen tension: cell wallthickening and localization of the 16-kilodalton alpha-crystallin homolog//J. Bacteriol. 1998- V. 180. - P. 801-808.
152. Da Silva E.M., Soares A.M., Moreno A.J. The use of the mitochondrial transmembrane electric potential as an effective biosensor in ecotoxicological research// Chemosphere. -1998. V. 36. - No. 10. - P. 2375-2390.
153. Damelin L.H., Vokes S., Whitcutt J.M., Damelin S.B., Alexander J.J. Hormesis: a stress response in cells exposed to low levels of heavy metals// Hum. Exp. Toxicol. 2000. -V. 19.- No. 7.-P. 420-430.
154. Dang P., Madan A.K. Structure-activity study on anticonvulsant (thio) hydantoins using molecular connectivity indices// J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1994. - V. 34. N5. - P. 1162-1166.
155. Dauner M., Bailey J.E., Sauer U. Metabolic flux analysis with a comprehensive isotopomer model in Bacillus subtilisH Biotechnol. Bioeng. 2001. - V. 76. N2.: 144-156
156. De Meo M., Laget M., Castegnaro M., Dumenil G. Genotoxic activity of potassium permanganate in acidic solutions// Mutat. Res. 1991. - V. 260. No. 3. - P. 295-306.
157. Delbruck M. Unites biologiques douees de continuité genetique. P.: C.N.R.S. - 1949.
158. Dikstein S., Hawkes R.B. Metabolically regulated cyclical contractures in microinjected Spirostomum: a pharmacological study// Experientia. 1976 - V. 32. No.8. -P.1029-1031.
159. Dimroth P., Wang H., Grabe M., Oster G. Energy transduction in the sodium F-ATPase of Propiomgemum modestum // Proc. Natl. Acad. Sci. 1999. - V. 96. - № 9. - P. 4924-4929.
160. Dixon L.R. The complete blood count: physiologic basis and clinical usage// J. Perinat. Neonatal. Nurs. 1997. - V. 11. - P. 1-18.185
161. Dixon N.E., Gazzola T.C., Blakeley R.L., Zermer B. Jack bean urease (EC 3.5.1.5). A metalloenzyme. A simple biological rolefor nickel?// J. Am. Chem. Soc. 1975. - V. 97. -No. 14. - P. 4131-4133.
162. Dominguez M.C., Sole E., Goni C., Ballabriga A. Effect of aluminum and lead salts on lipid peroxidation and cell survival in human skin fibroblasts// Biol. Trace Elem. Res. 1995. -V. 47. - No. (1-3). - P. 57-67.
163. Dunbar L.A., Caplan M.J. Ion pumps in polarized cells: sorting and regulation of the Na',K+- and H+,K+-ATPases// J. Biol. Chem. 2001. - Vol. 276. - No. 32. - P. 29617-29620.
164. Duncan T.M., Bulygin V.V., Zhou Y., Hutcheon M.L., Cross R.L. Rotation of subunits during catalysis by Escherichia coli FrATPase// Proc. Natl. Acad. Sci. 1995. - V. 92. - No. 24. P. 10964-10968.
165. Elston T., Wang H., Oster G. Energy transduction in ATP synthase//Nature. 1998. -V. 391. - P. 510-513
166. Emanuel N.M. Kinetics and free-radical mechanisms of ageing and carcinogenesis// I ARC Sci. Publ. -1985 V. 58. P. 127-150.
167. Emanuel N.M. Kinetics and the free-radical mechanisms of tumor growth// Ann. N. Y. Acad. Sci. 1973. - V. 222. - P. 1010-1030.
168. Engelbrecht S., Junge W. ATP synthase: a tentative structural model// FEBS Lett. -1997,-V. 414. No. 3. - P. 485-491.
169. Epifanova O.I., Polunovsky V.A. Cell cycle controls in higher eukaryotic cells: resting state or a prolonged Glpenod?// J. Theor. Biol. 1986. - V. 120. - No. 4. - P. 467-477.
170. Ermolli M., Menne C., Pozzi G., Serra M.A., Clerici L.A. Nickel, cobalt and chromium-induced cytotoxicity and intracellular accumulation in human hacat keratinocytes// Toxicology. 2001. - V. 159. - No (1-2). - P. 23-31.186
171. Ershov Iu. A., Kublik L. N., Pleteneva T.V., Eidus L. Kh. Toxic effects of heavy metal salts on intact and irradiated cultured mammalian cells// Biull. Eksp. Biol. Med. 1992. -V. 113. -P. 280-283.
172. Ershov Yu.A., Pleteneva T.Y. On a thermodynamic and kinetic methods of evaluation of the toxicity of arsenic compounds//Toxicol. Environ. Chem. 1983. - V. 7. - № 1. - P. 4146.'
173. Evans T.C., Jehle D. The red cell distribution width// J. Emerg. Med. 1991. -V. 9. -V. 71-74.
174. Ezaki B., Sivaguru M., Ezaki Y., Matsumoto H., Gardner R.C. Acquisition of aluminum tolerance in Saccharomyces cerevisiae by expression of the BCB or NtGDIl gene derived from plants// FEMS Microbiol. Lett. 1999. - V. 171. -No. 2. - P. 81-87.
175. Famularo G., Pieluigi M., Coccia R., Mastroiacovo P., De Simone C. Microecology, bacterial vaginosis and probiotics: perspectives forbacteriotherapy// Med. Hypotheses. 2001 -V. 56.-N4.-P. 421-430.
176. Fischer E., Keleti T. Sigmoidal substrate saturation curves in Michaelis-Menten mechanism as an artefact// Acta Biochim. Biophys. Acad. Sci. Hung. 1975. - V. 10. - N 3. -P. 221-227.
177. Fitin A.F. Synchronous (synphaseous) additive models for mitochondrial ATP synthetase complex and for other energy transducing systems of cells (a hypothesis)// Mol. Biol. (Mosk) 1982. - V. 16. - No. 4. - P. 661-675.187
178. Foster D.L., Filiingame R.H. Energy-transducing H+-ATPase of Escherichia coli. Purification, reconstitution, and subunit composition// J. Biol. Chem. 1979. - V. 254. No. 17. P. 8230-8236.
179. Foster D.L., Fillingame R.H. Stoichiometry of subunits in the H+-ATPase complex of Escherichia coli//. Biol. Chem. 1982. -V. 257. - No. 4. - P. 2009-2015.
180. Frieden C. Kinetic aspects of regulation of metabolic processes. The hysteretic enzyme concept//J. Biol. Chem. 1970. - V. 245. -N 21. - P. 5788-5799.
181. Frieden C. Slow transitions and hysteretic behavior in enzymes// Annu. Rev. Biochem. 1979. -V. 48. - P. 471-489.
182. Galkin M.A., Vinogradov A.D. Energy-dependent transformation of the catalytic activities of the mitochondrial F0xFrATP synthase// FEBS Lett. 1999. - V. 448. - No. 1. -P. 123-126.
183. Goel A., Madan A.K. Structure-activity study on antiulcer agents using Wiener's topological index and molecular connectivity index// J. Chem. Inf. Comput. Sei. 1995. - V. 35. N3,-P. 504-509.
184. Goldberg R.L., Kaplan S.R., Fuller G.C. Effect of heavy metals on human rheumatoid synovial cell proliferation and collagen synthesis// Biochem. Pharmacol. 1983. - V. 32. -No. 18.-P. 2763-2766.
185. Gosselin R.E., H.C. Hodge, R.P. Smith, M.N. Gleason. Clinical Toxicology of Commercial Products. 4th ed. Baltimore: Williams and Wilkins. 1976. - 238 p.
186. Grange JM. The biology of the genus Mycobacterium// Soc. Appl. Bacteriol. Symp. Ser. 1996 - V. 25.-P. 1S-9S.188
187. Graske A., Thuvander A., Johannisson A., Gadhasson I., Schutz A., Festin R., Wicklund G.A. Influence of aluminium on the immune system an experimental study on volunteers// Biometais. - 2000. - V. 13. - No. 2. - P. 123-133.
188. Grebennikova T. V., Zaberezhny A. D., Biketov S. F., Kalnov S. L., Aliper T. I., Nepoklonov E. A.// 10th European Congress ofclinical Microbiology and Infection Diseases. -Stockholm. 2000. - P. 69.
189. Grebennikova T.V., Nepoklonov E.A.// 9th European Congress of clinical Microbiology and Infection Diseases. Berlin. - 1999. - P. 204.
190. Grubmeyer C., Cross R.L., Penefsky H. Mechanism of ATP hydrolysis by beef heart mitochondrial ATPase. Rate constants for elementary steps in catalysis at a single site// J. Biol. Chem. 1982. - V. 257. -No. 20. - P. 12092-12100.
191. Gruca S., Wisniewski H.M. Cytochemical study on the effect of aluminum on neuronal Golgi apparatus and lysosomes//ActaNeuropathol. 1984. - V. 63. - No. 4. - P. 287-295.
192. Gupta S., Singh M., Madan A.K. Superendentic index: a novel topological descriptor for predicting biological activity// J. Chem. Inf. Comput. Sei. 1999. - V. 39. - No. 2. - P. 272-277.
193. Gupta S., Singh M., Madan A.K. Superpendentic index: a novel topological descriptor for predicting biological activity// J. Chem. Inf. Comput. Sei. 1999. - V. 39. - No. 2. -P. 272-277.
194. Hammes G.G. Relaxation spectrometry of biological system// Adv. Prot. Chem. 1968. - V.23. - P. 1-9.
195. Hammes G.G., Wu C.W. Kinetics of allosteric enzymes// Annu. Rev. Biophys. Bioeng. 1974. - V. 3. -P.:l-33.
196. Hammes G.G., Wu C.W. Regulation of enzyme activity. The activity of enzymes can be controlled by amultiplicity of conformational equilibria// Science. 1971. - V. 172 (989). -P. 1205-1211.
197. Hart B.A., Gong Q., Eneman J.D., Duneux-Lu C.C. In vivo expression of metallothionein in rat alveolar macrophages and type II epithelial cells following repeated cadmium aerosol exposures// Toxicol. Appl. Pharmacol. 1995. -V. 133. -No. 1. - P. 82-90.
198. Hartwig A., Beyersmann D. Comutagenicity and inhibition of DNA repair by metal ions in mammalian cells//Biol. Trace Elem. Res. 1989. -V. 21. - P. 359-365.
199. Hasan Z., Schlax C., Kuhn L., Lefkovits I., Young D., Thole J., Pieters J. Isolation and characterization of the micobacterial phagosome: segregation from endosomal/lysosomal path way// Mol. Microb. 1997. - V. 24. -N. 3. P. 545-553.
200. Hatase, O., Wakabayashi, T., Hayashi, H., and Green, D. E. Collapse and extension of the headpiece-stalk projections in mitochondrial electron transport particles// J. Bioenerg. -1972. -V. 3. P. 509-514.190
201. Hawkes R.B., Holberton D.V. Myonemal contraction of Spirostomum. III. The thermal dependence of contraction, relaxation and excitation-contraction coupling// J. Cell. Physiol. 1975. V. 87. No.2.-P. 253-263.
202. Hofmann G.E., Hand S.C. Comparison of messenger RNA pools in active and dormant Artemia franciscana embryos: evidence for translational control// J. Exp. Biol. 1992 - V. 164. P. 103-116.
203. Hurley L.S., Keen C.L., Baly D.L. Manganese deficiency and toxicity: effects on carbohydrate metabolism in the rat// Neurotoxicol. 1984. - V.5. - No. 1. - P. 97-104.
204. Hutter B, Dick T. Increased alanine dehydrogenase activity during dormancy in Mycobacterium smegmatisH FEMS Microbiol. Lett. 1998 - V. 167. - P. 7-11.
205. Inmon J., Stead A., Waters M.D., Lewtas J. Development of a toxicity test system using primary rat liver cells// In Vitro. 1981. - V. 17.-No. 11. - P. 1004-1010.
206. Junge W., Lill H., Engelbrecht S. ATP synthase: an electrochemical transducer with rotatory mechanics// Trends Biochem. Sci. 1997. - V. 22. - No. 11. - P. 420-423.
207. Jungwirth A., Paulmichl M., Lang F. Cadmium enhances potassium conductance in cultured renal epitheloid (MDCK)cells// Kidney Int. 1990. - V. 37. - No. 6. - P. 1477-1486.
208. Karelson M. Molecular descriptor in QSAR/QSPR. John Wiley & Sons, Inc. - 2000. -430 p.
209. Katritzky A.R., Gordeeva E.V. Traditional topological indices vs electronic, geometrical, and combined molecular descriptor in QSAR/QSPR research// J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1993. - V. 33. N6. - P. 835-857.191
210. King E.I., Altman C. A schematic method of deriving the rate lows for enzyme-catalyzed reactions// J. Phys. Chem. 1956. - V. 60. - P. 1375-1378.
211. Kironde F.A., Cross R.L. Adenine nucleotide-binding sites on beef heart Fi-ATPase. Conditions that affectoccupancy of catalytic and noncatalytic sites// J. Biol. Chem. 1986. -V. 261. - No. 27. - P. 12544-12549.
212. Kishi Y., Clements C., Mahadeo DC., Cotter D.A., Sameshima M. High levels of actin tyrosine phosphorylation: correlation with the dormantstate of Dictyostelium spores!/ J. Cell Sci. 1998 - V. 111. - P. 2923-2932.
213. Kitasato N. Comparative test for cytotoxicity of hexavalent and trivalent chromium in primary cultures of hepatocytes// Arch. Exp. Med. 1989. - V. 62. - No. 1. - P.53-57.
214. Klein G., Cotter D.A., Martin J.B., Satre M. A natural-abundance 13C-NMR study of Dictyostelium discoideum metabolism. Monitoring of the spore germination process// Eur. J. Biochem. 1990 - V. 193. - P. 135-142.
215. Korzeniewski B. Is it possible to predict any properties of oxidative phosphorylation in atheoretical way?//Mol. Cell. Biochem. 1998. - V. 184. - P. 345-358.
216. Koshland D.E.Jr. Conformational changes: how small is big enough?// Nat. Med. -1998. -V. 4. -N 10. -P. 1112-1114.192
217. Koshland D.E.Jr. Regulatory control through conformation changes in proteins// Adv. Enzyme Regul. 1968. -V. 6. P. 291-301.
218. Koshland D.E.Jr. The structural basis of negative cooperativity: receptors and enzymes// Curr. Opin. Struct. Biol. 1996. - V. 6. - N 6. - P. 757-761.
219. Koshland D.E.Jr., Neet K.E. The catalytic and regulatory properties of enzymes// Annu. Rev. Biochem. 1968. - V. 37. -:359-410.
220. Koshland D.E.Jr., Nemethy G., Filmer D. Comparison of experimental binding data and the theoretical models in proteins containing subunits// Biochem. 1966. - V. 5. -P. 365385.
221. Kotlyar A.B., Vinogradov A.D. Slow active/inactive transition of the mitochondrial NADH-ubiquinone reductase//Biochim. Biophys. Acta- 1990. -V. 1019. P. 151-158.
222. Kroos L., Zhang B., Ichikawa H., Yu Y.T. Control of sigma factor activity during Bacillus subtilis sporulation// Mol. Microbiol. 1999 -V. 31. - P. 1285-9124.
223. Krupka R. The application of vectorial coupling theory to the calcium pump// Biochim. Biophys. Acta. -1994. -V. 1193. P. 179-185.
224. Kuffner R., Zimmer R., Lengauer T. Pathway analysis in metabolic databases via differential metabolic display(DMD)// Bioinformatics. 2000. - V. 16. - P. 825-836.
225. Kurganov B.I. New approach to analysis of deviations from hyperbolic law in enzyme kinetics// Biochemistry.- 2000 V. 65. - N8. - P. 898-909.
226. Kurganov B.I. Specific ligand-induced association of an enzyme. A new model of dissociatingallostenc enzyme//J. Theor. Biol. 1983. -V. 103. - No. 2. -P. 227-245.
227. Las Heras G., Milla F., Ribera J.M., Onol A., Feliu E. Evaluation of the System 9000-AX autoanalyzer// Sangre. 1993. - V. 38. - P. 97-102.
228. Lattore R., Hall J. Dipole potential measurements in asymmetric membranes. // Nature Lond. 1976. - V. 264. - P. 363-363.193
229. Lawson J.E., Park S.H., Mattison A.R., Yan J., Reed L.J. Cloning, expression, and properties of the regulatory subunit of bovine pyruvatedehydrogenase phosphatase// J. Biol. Chem. 1997. -V. 272. - No. 50. - P. 31625-31629.
230. Lazdunski M., Petitclerc C., Chappelet D., Lazdunski C. Flip-flop mechanisms in enzymilogy. A model of the alkaline phosphatase of E. coli.ll Eur. J. Biochem. 1971. - V. 20. -P. 124-139.
231. Lee B.H., Murugasu-Oei В., Dick T. Upregulation of a histone-like protein in dormant Mycobacterium smegmatisH Mol. Gen. Genet. 1998 - V. 260. - P. 475-479.
232. Lehninger A.L. The mitochondrion. Moleccular basis of structure and function. N.Y.: W.A. Benjamin. - 1964.
233. Lewis Mc, W.C.// Trans. Chem. Soc. 1918. -V. 113. - P. 471-475.
234. Lill H., Hensel F., Junge W., Engelbrecht S. Cross-linking of engineered subunit 5 to (а(З)з in chloroplast F-ATPase// J. Biol. Chem. 1996. - V. 271. - No. 51. - P. 32737-32742.
235. Linz JE, Orlowski M. Regulation of gene expression during aerobic germination of Mucor racemosus sporangiospores// J. Gen. Microbiol. 1987 - V. 133. - P. 141-148.
236. Liu J., Kershaw W.C., Klaassen C.D. The protective effect of metalllothionein on the toxicity of various metals in primary hepatocyte culture// Toxil. Appl. Pharmacol. 1991. - V. 107. - P. 27-34.
237. Mann S. The Chemistry of Form// Angew Chem. Int. Ed. Engl. 2000. - V. 39. - No. 19. - P. 3392-3406.194
238. Mariani F., Cappelli G., Riccardi G., Colizzi V. Mycobacterium tuberculosis H37Rv comparative gene-expression analysis in synthetic medium and human macrophage// Gene. -2000. -V. 253. P. 281-291
239. Marti H.R., Fischer S., Killer D., Burgi W. Can automated haematology analyzer discriminate thalassaemia from iron deficiency?// Acta Haematol. 1987. - V. 78. - P. 180183.
240. Martinek K. Micellar enzymology: potentialities in fundamental and applied areas// Biochem. Int. 1989. - V. 18. No. 5. P. 871-893.
241. Martinek K., Levashov A.V., Klyachko N., Khmelnitski Y.L., Berezin I.V. Micellar enzymology//Eur. J. Biochem. 1986. -V. 155. - No. 3. - P. 453-468.
242. Mekenyan O.G., Schultz T.W., Veith G.D., Kamenska V. "Dynamic" QSAR for semicarbszide-induced mortality in frog embryos// J. Appl. Toxicol. 1996. - V. 16. - N4. -P. 355-363.195
243. Mekenyan O.G., Stioyanova G., Kamenska V., Davkov D., Pejkov P. Bronchospasmolytic activity and toxicity modeling of theophylline derivates by a microcomputer method// Arzeneimittelforschung. -1993. V. 43. - P. 1341-1350.
244. Mendes P., Kell D.B., Westerhoff H.V. Why and when channelling can decrease pool size at constant net flux in a simpledynamic channel// Biochim. Biophys. Acta. 1996. - V. 1289. P. - 175-186.
245. Mendes P., Kell D.B., Westerhoff H.V. Why and when channelling can decrease pool size at constant net flux in a simple dynamic channel// Biochim. Biophys. Acta. 1996. - V. 1289.-No. 2.-P. 175-186.
246. Mendiratta S., Madan A.K. Structure-activity study on antiviral 5-vmylpyrimidine nucleoside analogs using Wiener's topological index// J. Chem. Inf. Comput. Sei. 1994. - V. 34. N4.-P. 867-871.
247. Menz R.I., Walker J.E., Leslie A.G. Structure of bovine mitochondrial FrATPase with nucleotide bound to all three catalytic sites: implications for the mechanism of rotary catalysis//Cell. -2001. -V. 106. -No. 3. P. 331-341.
248. Michaelis L., Menten M.L. Die Kinetik der Invertinwirkung// Biochem. Z. 1913. - B. 49. P. 333-337.
249. Minkov IB., Fitin A.F., Vasilyeva E.A., Vinogradov A.D. Mg2+-induced ADP-dependent inhibition of the ATPase activity of beef heart mitochondrial coupling factor VJI Biochem. Biophys. Res. Commun. 1979 - V.89. - No. 4. - P. 1300-1306.
250. Mitchel P. Proton current flow in mitochondrial systems // Nature. 1967. - V.213. - № 72.-P. 137.
251. Monod J., Changeux J.P., Jacob F. Allosteric proteins and cellular control// J. Mol. Biol. - 1965. -V. 6. - P. 12-34.
252. Monod J., Wyman J., Changeux J.P. On the nature of allosteric transitions: a plausible model//-J. Mol. Biol. 1965. -V. 12. - P. 88-118.
253. Moulding TS. Need to define colonial morphology of M avzwm-intracellulare when reporting susceptibility test results//Tubercle. 1983. -V. 64. -No. 2. -P. 142-143.
254. Naarala J.T., Loikkanen J.J., Ruotsalainen M.H., Savolainen K.M. Lead amplifies glutamate-induced oxidative stress// Free Radic. Biol. Med. 1995. - V. 19. - No. 5. P. 689693.
255. Nalecz-Jawecki G., Rudz B., Sawicki J. Evaluation of toxicity of medical devices using Spirotox and Microtox tests: I. Toxicity of selected toxicants in various diluents// J. Biomed. Mater. Res. 1997. -V. 35. No.l. P. 101-105.
256. Nalecz-Jawecki G., Sawicki J. Spirotox—a new tool for testing the toxicity of volatile compounds//Chemosphere. 1999-V. 38.-No. 14-P. 3211-3218.
257. Nalecz-Jawecki G., Sawicki J. Toxicity of inorganic compounds in the Spirotox test: a miniaturized version of the Spirostomum ambiguum test// Arch. Environ. Contam. Toxicol. -1998. -V. 34. No.l. -P. 1-5.
258. Nikandrov V.V. Inorganic semiconductors as photosensitizers in biochemical redox reactions// Membr. Cell. Biol. 1998. - V. 12. - No. 5. - P. 755-769.
259. Noji H., Yasuda R., Yoshida M., Kinosita K. Jr. Direct observation of the rotation of FrATPase//Nature. 1997. -V. 386(6622). P. 299-302.197
260. Nonlinear Programming. Rosen J.B. ed. L.: Academic Press. - 1970. - 135 p.
261. Palsson B.O., Lightfoot E.N. Mathematical modelling of dynamics and control in metabolic networks. I. On Michaelis-Menten kinetics// J. Theor. Biol. 1984. - V. 111. - No. 2.-P. 273-302.
262. Patton W.N., Cave R.J., Harris R.I. A study of changes in red cell volume and hemoglobin concentration during phlebotomy induced iron deficiency and iron repletion using Technicon HI//Clin. Lab. Haematol. 1991. - V. 13.-P. 153-161.
263. Pleteneva T.V. On electrochemical method of evaluating the toxicity of inorganic compounds// The first international conference of electrochemistry and its applications. -Luxor. South Valley University, Qena,Egypt. 1996. - P. 245-248.
264. Pleteneva T.V. Physicochemical factors of inorganic compounds toxic actions// 4-th European Biological Inorganic Chemistry Conference EUROBIC-4. - 1998. - Sevilia, Spain P. MM-27.
265. Prigogine I., Nicolis G., Babloyantz A. Nonequilibrium problems in biological phenomena// Ann. N. Y. Acad. Sci. 1974. - V. 231. N 1. - P. 99-105.
266. Ramachandran G.N., Ramakrishna C., Sasisekharan V. Stereochemistry of polypeptide chain configuration//J. Mol. Biol. -1963. V. 7. - P. 95-101.
267. Rao K.S. Effects of aluminium salts on synaptosomal enzymes an in vitro kinetic study// Biochem. Int. - 1990. - V. 22. - No. 4. - P. 725-734.
268. Rattan A., Kalia A., Ahmad N. Multidrug-resistance Mycibacteria tybercilosis: molecular perspaective// Emerg. Inf. Dis. 1998. - V.4. - N2. - P. 195-207.
269. Rodilla V., Miles A.N., Jenner W., Hawksworth G.M. Exposure of cultured human proximal tubular cells to cadmium, mercury, zinc, and bismuth: toxicity and metfllothionein induction// Chem. Biol. Interact. 1998. - V. 115. - P. 71-83.
270. Roscher A., Emsley L., Raymond P., Roby C.J. Unidirectional steady state rates of central metabolism enzymes measuredsimultaneously in a living plant tissue// J. Biol. Chem. -1998.- V. 273. P. 25053-25061.
271. Rudolf E., Peychl J., Cervinka M. Toxic effects of chromium acetate hydroxide on cells cultivated in vitro// Altern. Lab. Amm. 2001. - V. 29. - No. 2. - P. 163-177199
272. Sabbert D., Engelbrecht S., Junge W. Intersubunit rotation in active F-ATPase// Nature. 1996. - V. 381(6583). - P. 623-625.
273. Salerno C, Ovadi J, Keleti T, Fasella P. Kinetics of coupled reactions catalyzed by aspartate aminotransferase andglutamate dehydrogenase// Eur. J. Biochem. 1982. - V. 121. -No. 3.-P. 511-517.
274. Sato K, Kawashima S. Calpain function in the modulation of signal transduction molecules//J. Biol. Chem. 2001.-V. 382. - P. 743-751.
275. Schott E.J., Gardner R.C. Aluminum-sensitive mutants of Saccharomyces cerevisiaell Mol. Gen. Genet. 1997. - V. 254. - No. 1. - P. 63-72.
276. Schultz B.E., Chan S.I. Structures and proton-pumping strategies of mitochondrial respiratory enzymes// Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2001. - V. 30. - P. 23-65.
277. Schultz BE., Chan S.I. Structures and proton-pumping strategies of mitochondrial respiratory enzymes// Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2001. -V. 30. - P. 23-65.
278. Seoane A.I., Dulout F.N. Genotoxic ability of cadmium, chromium and nickel salts studied by kinetochore staining in the cytokinesis-blocked micronucleus assay// Mutat. Res. -2001. V. 490. No. 2. P. 99-106.
279. Shopsis C. Antagonism of cadmium cytotoxicity by differentiation inducers// Cell. Biol. Toxicol. 1994. -V. 10. -No. 3. P. 191-205.
280. Shukla G.S., Chiu J, Hart B.A. Cadmium-induced elevations in the gene expression of the regulatory subunit of gamma-glutamylcysteine synthetase in rat lung and alveolar epithelial cells//Toxicology. 2000. - V. 151. - No. (1-3). - P. 45-54.
281. Shyu Y.T., Foegeding P.M. Purification and some characteristics of a calcium-bmding protein from Bacilluscereus spores!7 J. Gen. Microbiol. 1991 - V. 137 - P. 1619-1623.
282. Singer S., Nicolson G. The fluid mosaic model of the structure of cell membranes // Science. 1972. - V. 175. - P. 720.200
283. Snyder C.A., Valle C.D. Lymphocyte proliferation assays as potential biomarkers for toxicant exposures// J. Toxicol. Environ. Health. 1991. - V. 34. - No. 1. - P. 127-139.
284. Souid A.K., Penefsky H. Energetics of ATP dissociation from the mitochondrial ATPase during oxidative phosphorylation//J. Biol. Chem. 1995. - V. 270. No. 16 - P. 90749082.
285. Storer A.C., Cornish-Bowden A. The kinetics of coupled enzyme reactions// Biochem. j. 1974. -V. 141.-P. 205-209.
286. Suzuki K.T., Rui M., Ueda J., Ozawa T. Production of hydroxyl radicals by copper-containing metallothionein: roles as prooxidant// Toxicol. Appl. Pharmacol. 1996. - V. 141. -P. 231-237.
287. Swain C., Chainy G.B. In vitro stimulation of chick brain lipid peroxidation by aluminium, and effects of tiron, EDTA and some antioxidants// Indian J. Exp. Biol. 2000. -V. 38.-No. 12.-P. 1231-1235.
288. Syroeshkin A.V., Bakeeva L.E., Cherepanov D.A. Contraction transitions of FrF0 ATPase during catalytic turnover// Biochim. Biophys. Acta. 1998. - V. 1409. - P. 59-71.
289. Syroeshkin A.V., Vasilyeva E.A., Vinogradov A.D. ATP synthesis catalyzed by the mitochondrial FrF0 ATPase is not reversal of its ATPase activity// FEBS Lett. 1995. - V. 366. - P. 29-32.201
290. Syroeshkin A.V., Vasilyeva E.A., Vinogradov A.D. ATP synthesis catalyzed by the mitochondrial FrF0 ATPase is not reversal of its ATPase activity// FEBS Lett. 1995. - V. 366. - P. 29-32.
291. Takeyasu K., Omote H., Nettikadan S., Tokumasu F., Iwamoto-Kihara A., Futai M. Molecular imaging of Escherichia coli F0FrATPase in reconstituted membranes using atomic force microscopy// FEBS Lett. 1996. - V. 392. - No. 2. - P. 110-113.
292. Tamai K.T., Gralla E.B., Ellerby L.M., Valentine J.S., Thiele D.J. Yeast and mammalian metallothioneins functionally substitute for yeast copper-zinc superoxide dismutase// Proc. Natl. Acad. Sci. 1993. -V. 90. - P. 8013-8017.
293. Thom R. A mathematical approach to morphogenesis: archetypal morphologies// Wistar Inst. Symp. Monogr. 1969. - V. 9. - P. 165-174.
294. Todd P., Hymer W.C., Morrison D R., Goolsby C.L., Hatfield J.M., Kunze M.E., Motter N.N. Cell bioprocessing in space: applications of analytical cytology// Physiologist. -1988.-V. 31.-P. S52-S55.
295. Trautz// Z. Anorg. Chem. 1918. - B. 97. - P. 1-5.
296. Troncoso J.C., Hoffman P.N., Griffin J.W., Hess-Kozlow K M., Price D.L. Aluminum intoxication: a disorder of neurofilament transport in motor neurons// Brain Res. 1985. - V. 342. -No. 1. - P. 172-175.
297. Vasilyeva E.A., Minkov I.B., Fitin A.F., Vinogradov A.D. Kinetic mechanism of mitochondrial adenosine triphosphatase. Inhibition by azide and activation by sulphite// Biochem. J. 1982. - V. 202. - No. 1. - P. 15-23.
298. Venugopal B., Luckey T.D. Metal toxicity in mammals. N.Y.: Plenum Press. - 1978. -V.2. -409 p.
299. Vera A., Monies M., Usero J.L., Casado J. Quantitave structure-activity relationship study of the biophysicochemical behaviour of nitrosamine// J. Pharm. Sci. -1992. V. 81. -N8.-P. 791-796.
300. Waddington C.H., Thorn R. On cell differentiation// Riv. Biol. 1981. - V. 74. No. (12). P. 213-227.
301. Walker J.E., Collinson I.R. The role of the stalk in the coupling mechanism of F^q-ATPases// FEBS Lett. 1994. - V. 346. - No. 1. - P. 39-43.
302. Walter C. Steady-state application in enzyme kinetics. N.Y.: Rinald Press. - 1965. -247 p.
303. Wharton C.W., Szawelski R.J. Half-time analysis of the integrated Michaelis equation// Biochem. J. 1982. - V. 203. - P. 351-360.203
304. Wilkenes S., Capaldi R.A. ATP syhthase's second stalk comes into focus// Nature. -1998,-V. 393. P. 29.
305. Wilkens S., Capaldi R.A. Electron microscopic evidence of two stalks linking the Ft and F0 parts of the Escherichia coli ATP synthase// Biochim. Biophys. Acta. 1998. - V. 1365. - No. (1-2). - P. 93-97.
306. Williams N., Hullihen J., Pedersen P.L. Ligand binding studies of the Fi moiety of rat liver ATP synthase: implications about the enzyme's structure and mechanism// Biochemistry. 1987. V. 26. No. 1. - P. 162-169.
307. Wlostowski T. Involment of metallothionein and cooper in cell proliferation// Biometals. 1993. - V. 6. - P. 71-76.
308. Xiao R., Penefsky H. Unisite catalysis and the 5 subunit of FrATPase in Escherichia colli/ J. Biol. Chem. 1994. - V. 269. - P. 19232-19237.
309. Yasuda R., Noji H., Yoshida M., Kinosita K. Jr., Itoh H. Resolution of distinct rotational substeps by submillisecond kinetic analysis of FrATPase// Nature. 2001. - V. 410(6831). P. 898-904.
310. Yu E.W., Koshland D.E.Jr. Propagating conformational changes over long (and short) distances in proteins// Proc. Natl. Acad. Sci. 2001. - V. 98. - N 17. -P. 9517-9520.
-
Похожие работы
- Математическое моделирование кинетики клеточной популяции кишечного эпителия
- Математическое моделирование кинетики клеточной популяции кишечного эпителия
- Математическое моделирование защитной иммунофизиологической реакции при пневмонии
- Модели и методы комплексных исследований медико-биологических процессов в онкологии
- Значение биоспектрофотометрии нативной флуоресценции клеток покровных тканей и крови для медицинских исследований
-
- Системный анализ, управление и обработка информации (по отраслям)
- Теория систем, теория автоматического регулирования и управления, системный анализ
- Элементы и устройства вычислительной техники и систем управления
- Автоматизация и управление технологическими процессами и производствами (по отраслям)
- Автоматизация технологических процессов и производств (в том числе по отраслям)
- Управление в биологических и медицинских системах (включая применения вычислительной техники)
- Управление в социальных и экономических системах
- Математическое и программное обеспечение вычислительных машин, комплексов и компьютерных сетей
- Системы автоматизации проектирования (по отраслям)
- Телекоммуникационные системы и компьютерные сети
- Системы обработки информации и управления
- Вычислительные машины и системы
- Применение вычислительной техники, математического моделирования и математических методов в научных исследованиях (по отраслям наук)
- Теоретические основы информатики
- Математическое моделирование, численные методы и комплексы программ
- Методы и системы защиты информации, информационная безопасность